MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Zymomonas mobilis subsp. mobilis NCIB 11163 plasmid pZA1003

Total Repeats: 100

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013358	T	6	6	14	19	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013358	A	6	6	58	63	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013358	TAA	2	6	256	261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260738836
4	NC_013358	TGT	2	6	269	274	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260738836
5	NC_013358	CTG	2	6	286	291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260738836
6	NC_013358	TC	3	6	387	392	0 %	50 %	0 %	50 %	260738836
7	NC_013358	GT	3	6	393	398	0 %	50 %	50 %	0 %	260738836
8	NC_013358	CTTT	2	8	416	423	0 %	75 %	0 %	25 %	260738836
9	NC_013358	TTG	2	6	461	466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260738836
10	NC_013358	TCC	2	6	500	505	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260738836
11	NC_013358	TGG	2	6	521	526	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260738836
12	NC_013358	ATG	2	6	578	583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260738836
13	NC_013358	CAGC	2	8	601	608	25 %	0 %	25 %	50 %	260738836
14	NC_013358	AGG	2	6	614	619	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260738836
15	NC_013358	GCT	2	6	720	725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260738836
16	NC_013358	AAT	2	6	742	747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260738836
17	NC_013358	GCT	3	9	762	770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260738836
18	NC_013358	CT	3	6	1010	1015	0 %	50 %	0 %	50 %	260738836
19	NC_013358	TCT	2	6	1080	1085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260738836
20	NC_013358	TCA	2	6	1128	1133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260738836
21	NC_013358	TTC	2	6	1149	1154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260738836
22	NC_013358	G	6	6	1157	1162	0 %	0 %	100 %	0 %	260738836
23	NC_013358	CTT	2	6	1178	1183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260738836
24	NC_013358	TGA	2	6	1207	1212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260738836
25	NC_013358	ATG	2	6	1223	1228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260738836
26	NC_013358	ATA	2	6	1311	1316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260738836
27	NC_013358	GAAA	2	8	1355	1362	75 %	0 %	25 %	0 %	260738836
28	NC_013358	CAC	2	6	1436	1441	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260738836
29	NC_013358	CT	3	6	1466	1471	0 %	50 %	0 %	50 %	260738836
30	NC_013358	AGC	2	6	1502	1507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260738836
31	NC_013358	TGT	2	6	1591	1596	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260738837
32	NC_013358	ATT	2	6	1696	1701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260738837
33	NC_013358	TTTG	2	8	1706	1713	0 %	75 %	25 %	0 %	260738837
34	NC_013358	AAGAA	2	10	1867	1876	80 %	0 %	20 %	0 %	260738837
35	NC_013358	CAA	2	6	1908	1913	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_013358	C	6	6	1933	1938	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
37	NC_013358	TTAA	2	8	1947	1954	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013358	A	6	6	1962	1967	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013358	TTG	2	6	1976	1981	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260738838
40	NC_013358	GTTC	2	8	2004	2011	0 %	50 %	25 %	25 %	260738838
41	NC_013358	T	6	6	2033	2038	0 %	100 %	0 %	0 %	260738838
42	NC_013358	GAT	2	6	2104	2109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260738838
43	NC_013358	AGA	2	6	2145	2150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260738838
44	NC_013358	T	6	6	2313	2318	0 %	100 %	0 %	0 %	260738839
45	NC_013358	TCAC	2	8	2375	2382	25 %	25 %	0 %	50 %	260738839
46	NC_013358	TTG	2	6	2430	2435	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260738839
47	NC_013358	TCA	2	6	2502	2507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260738839
48	NC_013358	T	7	7	2633	2639	0 %	100 %	0 %	0 %	260738840
49	NC_013358	ATG	2	6	2677	2682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260738840
50	NC_013358	GCT	3	9	2705	2713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260738840
51	NC_013358	TAC	2	6	2746	2751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260738840
52	NC_013358	CAG	2	6	2754	2759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260738840
53	NC_013358	CTT	2	6	2766	2771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260738840
54	NC_013358	TA	3	6	2787	2792	50 %	50 %	0 %	0 %	260738840
55	NC_013358	TTG	2	6	2794	2799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260738840
56	NC_013358	TAT	2	6	2823	2828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260738840
57	NC_013358	AAT	2	6	2842	2847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260738840
58	NC_013358	T	6	6	2898	2903	0 %	100 %	0 %	0 %	260738840
59	NC_013358	TTGC	2	8	2907	2914	0 %	50 %	25 %	25 %	260738840
60	NC_013358	TAA	2	6	2935	2940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260738840
61	NC_013358	CAT	2	6	3051	3056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_013358	TAA	2	6	3082	3087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013358	AT	3	6	3088	3093	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013358	T	7	7	3096	3102	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013358	T	6	6	3104	3109	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013358	ATTT	2	8	3154	3161	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013358	ATC	2	6	3172	3177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_013358	TTA	2	6	3204	3209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013358	TATT	2	8	3249	3256	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013358	T	7	7	3267	3273	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013358	T	9	9	3288	3296	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013358	ATA	2	6	3304	3309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013358	A	6	6	3311	3316	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013358	ATA	2	6	3335	3340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013358	AAT	2	6	3371	3376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013358	ATT	2	6	3391	3396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260738841
77	NC_013358	ATTCT	2	10	3399	3408	20 %	60 %	0 %	20 %	260738841
78	NC_013358	TGA	2	6	3457	3462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260738841
79	NC_013358	T	6	6	3473	3478	0 %	100 %	0 %	0 %	260738841
80	NC_013358	TTG	2	6	3493	3498	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260738841
81	NC_013358	T	6	6	3536	3541	0 %	100 %	0 %	0 %	260738841
82	NC_013358	T	8	8	3687	3694	0 %	100 %	0 %	0 %	260738841
83	NC_013358	AGT	2	6	3715	3720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260738841
84	NC_013358	GTT	2	6	3920	3925	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260738841
85	NC_013358	CAA	2	6	3933	3938	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260738841
86	NC_013358	GCA	2	6	4034	4039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260738841
87	NC_013358	TAA	2	6	4056	4061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260738841
88	NC_013358	AAC	2	6	4090	4095	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260738841
89	NC_013358	TAA	2	6	4111	4116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260738841
90	NC_013358	T	6	6	4158	4163	0 %	100 %	0 %	0 %	260738841
91	NC_013358	AT	3	6	4191	4196	50 %	50 %	0 %	0 %	260738841
92	NC_013358	TATAT	2	10	4204	4213	40 %	60 %	0 %	0 %	260738841
93	NC_013358	TAA	2	6	4224	4229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260738841
94	NC_013358	GCTAG	2	10	4253	4262	20 %	20 %	40 %	20 %	260738841
95	NC_013358	ATT	2	6	4346	4351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260738841
96	NC_013358	TTA	2	6	4376	4381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_013358	AT	3	6	4390	4395	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_013358	T	6	6	4395	4400	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013358	T	7	7	4494	4500	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013358	A	6	6	4505	4510	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.